מזג האוויר באיי פי פי חם למדי, עם הטמפרטורה הגבוהה ביותר המגיעה עד 34 מעלות צלזיוס. מצד שני, הטמפרטורה הנמוכה ביותר יורדת ל-25 מעלות צלזיוס נוחות. זה הופך את האיים ליעד מושלם למי שנהנה מאקלים טרופי. החום עז למדי, אך הרוח הקרירה הנושבת במהירות של 16 קמ"ש מספקת הפוגה נחוצה.
גשמים הם גם תופעה נפוצה באיים, עם עד 30 מ"מ של גשם צפוי. זה מוסיף נופך מרענן לאקלים החם הכללי. למרות הגשם, השמש עדיין מצליחה להציץ ולהטיל זוהר יפהפה על האיים. מזג האוויר, עם שילוב של חום, רוחות קרירות וגשם מדי פעם, הופך את איי פי פי למקום מעניין לבקר בו.
